window.close()で確認ダイアログを出さないで閉じる。

いろいろ方法があるようですが、

window.close()

の代わりに、

window.open("about:blank","_self").close()

同様に、

window.parent.close()
や
window.top.close()

の代わりに、

window.open("about:blank","_parent").close()
や
window.open("about:blank","_top").close()