comm1バッチファイル

ファイル１にあって、ファイル２にない行を標準出力に出します。

comm1.cmd ファイル１ ファイル２

@echo off
findstr /X /L /V /G:%2 %1

unixのcommは入力がsortされている必要がありますが、こちらは必要ありません。
ただし、ファイル１は重複がないように、uniqされてる必要があります。もし、重複があると、重複します。