comm3バッチファイル

ファイル１とファイル２に共通な行を標準出力に出します。

comm3.cmd ファイル１ ファイル２

@echo off
findstr /X /L /G:%2 %1

unixのcommは入力がsortされている必要がありますが、こちらは必要ありません。
ただし、ファイル１は重複がないように、uniqされてる必要があります。もし、重複があると、重複します。