PowerShell 2.0があれば、バッチファイルからそのコンソールウィンドウを非表示/最小化/最大化/元に戻す。

コンソールウィンドウを非表示にします。

PowerShell -WindowStyle Hidden -Command Exit

コンソールウィンドウを最小化します。

PowerShell -WindowStyle Minimized -Command Exit

コンソールウィンドウを最大化します。

PowerShell -WindowStyle Maximized -Command Exit

コンソールウィンドウを元に戻します。

PowerShell -WindowStyle Normal -Command Exit

バッチファイルだけでなく、PowerShellスクリプトでも同じです。