仮想フォルダ、shell:name、shell:::{clsid}、uwp、プロトコル、などのショートカットを作る。

エクスプローラの新規作成、ショートカットでは、

explorer.exe shell:::{clsid}

のショートカットを作って誤魔化すところ、

shell:::{clsid}

のショートカットが

Set wShell=CreateObject("WScript.Shell")
Set Link=wShell.CreateShortCut("New Link.lnk")
Link.TargetPath="shell:::{clsid}"
Link.Save

で、ごく普通に作れる。

NewLink.vbs

Set wShell=CreateObject("WScript.Shell")
Set Link=wShell.CreateShortCut("New Link.lnk")
Link.TargetPath=InputBox("TargetPath","New Link",Link.TargetPath)
Link.Save

uwpのショートカットは、パス名、または、プロトコルで作る。メールアプリなら、

パス名、
shell:AppsFolder\microsoft.windowscommunicationsapps_8wekyb3d8bbwe!microsoft.windowslive.mail

プロトコル、
outlookmail:

shell: 以外のプロトコルは、インターネットショートカット(.url)のほうが簡単でよいかも。